Chin J Emerg Resuse Disaster Med,My2023,Vd18Na5202四年5月第18卷第5期中国急教复苏与灾害医学杂志专家共识宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识中国医学救援协会重症医学分会摘要：医院获得性肺爽主要是指包括细菌、真菌、病毒、原虫及支/衣原体等病原体在入院48后引发的各类肺实质爽症。对于不明病原体感柒的医院蔟得性肺爽，宏基因组测序技术能够检测几乎所有病原体核酸，所以该技术尤为适用于病原检测。宏基因测序技术实验流程操作略显繁琐，分析流程复杂，检测结果冗长，因此对实验室操作人员及解读人员的素质要求颜高，对相关的质量控制也需要标准化。简述了该技术在医院获得性肺爽中的应用及关键环节的质量控制。关键词：医院获得性肺爽：宏基因组学测序技术：病原微生物中图分类号：563.1文献标识码：A文章编号：1673-6966(2023050561-08Expertconsensuson the clinical application of metagenomicsequencing technology in adult hospital-acquired pneumoniaThe Critical Care Medicine Branch of the China Association for Disaster and Emergency Rescue MedicineCorresponding authors:LUO Liang,E-mail:luoliang@mail.sysu.edu.cnAbstract:Hospital-acquired pneumonia is an lung parenchymal inflammation mainly caused by pathogens includingbacteria,fungi,viruses,protozoa and Mycoplasma/Chlamydia after 48 hours to admission.For hospital-acquiredpneumonia infected by unknown pathogens,mNGS technology can detect almost all pathogen nucleic acids,so thistechnique is particularly suitable for pathogen test.mNGS technology experiment operation is cumbersome,the analysisprocess is complex,and the test results are lengthy,so the quality requirements of laboratory operators and interpretersare quite high,and the relevant quality control also needs to be standardized.have been briefly described theapplication of this technology in hospital-acquired pneumonia and the quality control of key links.Key words:Hospital-acquired pneumonia;mNGS;Pathogenic microorganisms医院获得性肺炎(hospital--acquired pneumonia,原体及其耐药情况，及时恰当使用抗感染药物对于HAP)是指至少在入院48h后发生的肺炎，患者住院期HAP患者的诊疗和康复至关重要。传统的HAP病原间未接受有创机械通气、未处于病原感染的潜伏期，而微生物检测方法主要包括痰或支气管肺泡灌洗液于入院48h后新发，是常见的医院获得性感染疾病。(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)的涂片、培养、核酸2018年全国医院感染横断面调查报告显示，在26790检测以及血清样本生物标志物的免疫学检测，这些方例发生医院感染的患者中，共分离出医院感染病原菌法无法满足临床需求，尤其是无法快速识别罕见或者11965株，其中来自下呼吸道标本最多，占51.7%四。未知的病原体国。据调查分析，美国急诊医院获得性感染的发生率为宏基因组二代测序技术(metagenomics next4.0%,其中最常见的感染是肺炎，占21.8%。国内外generation sequencing,mNGS)通过直接提取临床样本研究结果均显示，HAP在医院获得性感染中所占比例中的核酸进行文库构建和高通量测序，利用生物信息居首位。与此同时，抗菌药物的不合理使用造成了医学算法分析样本中包含的病原微生物序列的种类及耐院耐药菌的产生，使得HAP诊断和治疗的难度增加，药基因和毒力基因，能够快速并且准确地检测各种临住院时间延长，医疗费用上升，发病率及病死率增床样本中的病原微生物，显著提高病原检测的敏感性，高。我国一项不同城市的教学医院对HAP临床调大大缩短检测时间。mNGS检测范围广泛，能同时查的结果显示，HAP患者的平均住院时间显著高于同检测细菌、真菌、病毒、寄生虫等，在罕见和新发病原体期其他住院患者，其住院平均治疗费用亦显著高于同的诊断及溯源上具有显著优势；同时，mNGS提高了肺期呼吸科住院患者平均住院费用P。因此，快速诊断病部混合感染及真菌感染的诊断准确性，所以对于检测基金项目：深圳市基础研究资助项目（编号：JCY20190809121801664)通信作者：罗亮，E-mail:luoliang@mail syst.edu.cn·561·
